07/05 (10h às 12h) – Aula
Teórica: Introdução à Modelagem Molecular e à Bioinformática –
Definições básicas; o dogma central da biologia molecular, genômica,
proteômica, bioinformática modelagem molecular, bioinformática estrutural, quimioinformática.
LaBiE
07/05 (14h00min às 16h00min) – Aula
Teórica: Bioinformática: bancos de dados de seqüência, matrizes de
substituição, alinhamento de seqüências.
LaBiE
07/05 (16h30min às 19h00min) – Aula
Prática: Bioinformática aplicada à Genômica e Proteômica. Homologia e
similaridade, análise de sequências, alinhamento par-a-par e pesquisa em bancos
de dados. Alinhamento múltiplo de sequências, árvores filogenéticas, perfis.
LaBiE
08/05 (9h00min às 13h00min) – Aula
Prática: Bioinformática aplicada à Genômica e Proteômica. Homologia e
similaridade, análise de sequências, alinhamento par-a-par e pesquisa em bancos
de dados. Alinhamento múltiplo de sequências, árvores filogenéticas, perfis
(continuação).
LaBiE
08/05 (14h às 16h) – Palestra
I: BIOINFORMÁTICA nas Ciências
Biológicas e Biomédicas
Dra Ana Beatriz Veiga (UFCSPA)
08/05 (16h30min às 19h00min) – Aula
Prática: Visualização de estruturas de proteínas e cálculo de
propriedades estruturais. Ferramentas encontradas na Web. Visualização e
classificação. Alinhamento estrutural.
LaBiE
09/05 (9h00min às 10h30min) – Palestra
II: Métodos experimentais de determinação da estrutura tridimensional
(3D) de macromoléculas biológicas: cristalografia de raios-X, RMN, limitações
Dr. Rafael Andrade Caceres (PUCRS)
09/05 (10h30min às 13h00min) – Aula
Prática: Visualização de estruturas de proteínas e cálculo de
propriedades estruturais. Trabalhando com o mapa de densidade eletrônica.
LaBiE
09/05 (14h às 18h) - Aula
Teórica: Modelagem Molecular, Métodos baseados na Química Quântica:
semi-empírico, ab initio, funcional de densidade. Métodos Baseados na
Mecânica Molecular. Minimização de energia. Análise conformacional.
Dr. Luiz Antônio Mazzini Fontoura (Ulbra)
10/05 (9h00min às 13h00min) – Aula
Prática: programas ArgusLab e Gaussian;
minimização de energia e análise
conformacional.
LaBiE
10/05 (14h00min às 15h30min) – Palestra
III: Docking molecular.
LaBiE
10/05 (16h00min às 18h00min) – Palestra
IV: Screening virtual de fármacos.
Dr. Walter Azevedo (PUCRS)
11/05 (9h00min às 13h00min) – Aula
Prática: Programa AutoDock; Docking molecular.
LaBiE
11/05 (14h às 18h) – Aula
Prática: Docking molecular (continuação).
LaBiE
14/05 (9h00min às 10h30min) – Palestra
V: Modelagem por homologia.
LaBiE
14/05 (11h00min às 13h00min) – Aula
Prática: Introdução ao sistema operacional Linux.
LaBiE
14/05 (14h00min às 19h00min) – Aula
Prática: Modelagem por homologia usando o programa Modeller
LaBiE
15/05 (8h30min às 12h30min)
15/05 (14h às 18h)
16/05 (8h30min às 12h30min) – Aula
Teórica: Simulações por Dinâmica Molecular.
Dr. Paulo Augusto Netz (UFRGS)
16/05 (14h às 18h) – Aula Prática: Simulações
por Dinâmica Molecular de um complexo fármaco-enzima.
LaBiE
17/05 (8h30min às 10h30min) – Palestra
VI: Princípios práticos de parametrização de ligantes.
LaBiE
17/05 (10h30min às 12h) – Aula
Prática: Simulações por Dinâmica Molecular de um complexo
fármaco-enzima (continuação).
LaBiE
17/05 (12h às 18h) – Aula
Prática: Simulações por Dinâmica Molecular de um complexo
fármaco-enzima (final).
LaBiE
18/05 (8h30min às 10h30min) – Palestra
VII: Simulação por Dinâmica Molecular de Ácidos Nucléicos.
Dr. Osmar Norberto de Souza (PUCRS)
18/05 (10h30min às 12h30min) – Palestra
VIII:
LaBiE
18/05 (14h00min às
16h00min) – Palestra IX: Simulações de Membranas
Biológicas
Dr. Hubert Stassen (UFRGS)
18/05 (16h30min às 19h00min) – Palestra
X: Simulações ADMET (Absorção, Distribuição, Metabolização e
Toxicidade).
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